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消化酵素（しょうかこうそ）とは、消化に使われる酵素のこと。分解される栄養素によって炭水化物分解酵素、タンパク質分解酵素、脂肪分解酵素などに分けられる。


炭水化物分解酵素
唾液、膵液
アミラーゼ ? デンプンを分解して主にマルトース（麦芽糖）に変える。
腸液
マルターゼ ?マルトースをグルコース（ブドウ糖）に変える。
ラクターゼ ?ラクトース（乳糖）をグルコースとガラクトースに変える。

タンパク質分解酵素
一般にプロテアーゼと呼ばれる。

胃液
ペプシン ? タンパク質を分解してより小さなペプトンにする。
レンニン
膵液
トリプシン ? タンパク質やペプトンを更に小さなポリペプチドやアミノ酸にする。塩基性アミノ酸残基にはたらく。
キモトリプシン ? タンパク質やペプトンを更に小さなポリペプチドやアミノ酸にする。芳香族アミノ酸残基にはたらく。
エラスターゼ ? タンパク質やペプトンを更に小さなポリペプチドやアミノ酸にする。脂肪族アミノ酸残基にはたらく。
カルボキシペプチターゼ ? ポリペプチドを分解してアミノ酸にする。カルボキシル末端のペプチド結合を切断。
腸液
アミノペプチダーゼ ? ポリペプチドを分解してアミノ酸にする。アミノ末端のペプチド結合を切断。

脂肪分解酵素
（*唾液）、胃液、膵液、（*腸液）
リパーゼ ? 脂肪（トリグリセリド）を最終的にグリセリンと脂肪酸に分解する。
　（※唾液には少量含まれる。リパーゼが腸液に含まれるとするかは解釈が分かれている）